Kurikulum pendidikan Fakultas Kedokteran UISU menggunakan Kurikulum Berbasis Kompetensi (KBK) yang disusun berdasarkan SKDI dan Visi, Misi Fakultas Kedokteran UISU. Kurikulum Fakultas Kedoktera UISU terdiri atas 2 tahapan, yaitu:
1. Tahap Sarjana Kedokteran
Tahap Sarjana Kedokteran dilaksanakan selama 7 semester dengan total 153 SKS


2. Tahap Profesi Dokter
Tahap Profesi Dokter dilaksanakan dalam 4 semester dengan total 40 SKS.

